Vantagens e limitações das ontologias formais na área biomédica

Autores

  • Stefan Schulz Centro Médico Universitário Freiburg, Instituto de Biometria Médica e Informática da Medicina, Freiburg, Alemanha
  • Holger Stenzhorn Centro Médico Universitário Freiburg, Instituto de Biometria Médica e Informática da Medicina, Freiburg, Alemanha
  • Martin Boeker Centro Médico Universitário Freiburg, Instituto de Biometria Médica e Informática da Medicina, Freiburg, Alemanha
  • Barry Smith Universidade de Buffalo,Departamento de Filosofia e Centro de Excelência em Bioinformática e Ciências Biológicas e Centro Nacional de Ontologia Biomédica, Buffalo, United States

DOI:

https://doi.org/10.3395/reciis.v3i1.818

Palavras-chave:

ontologia biomédica, lógica descritiva, ontologia formal, representação do conhecimento

Resumo

Propomos uma tipologia dos artefatos de representação para as áreas de saúde e ciências biológicas, e a associação dessa tipologia com diferentes tipos de ontologia formal e lógica, chegando a conclusões quanto aos pontos fortes e limitações da ontologia de diferentes tipos de recursos lógicos, enquanto mantemos o foco na lógica descritiva. Consideramos quatro tipos de representação de área: (i) representação léxico-semântica, (ii) representação de tipos de entidades, (iii) representação de conhecimento prévio, e (iv) representação de indivíduos. Defendemos uma clara distinção entre os quatro tipos de representação, de forma a oferecer uma base mais racional para o uso das ontologias e artefatos relacionados no avanço da integração de dados e interoperabilidade de sistemas de raciocínio associados. Destacamos que apenas uma pequena porção de fatos cientificamente relevantes em áreas como a biomedicina pode ser adequadamente representada por ontologias formais, quando estas últimas são concebidas como representações de tipos de entidades. Particularmente, a tentativa de codificar conhecimento padrão ou probabilístico pela utilização de ontologias assim concebidas é fadada à produção de modelos não intencionais e errôneos.

Publicado

31-03-2009

Como Citar

Schulz, S., Stenzhorn, H., Boeker, M., & Smith, B. (2009). Vantagens e limitações das ontologias formais na área biomédica. Revista Eletrônica De Comunicação, Informação & Inovação Em Saúde, 3(1). https://doi.org/10.3395/reciis.v3i1.818